蛋白互作用PPI图
蛋白质互作(Protein-Protein Interaction,PPI)图是一种展示蛋白质相互作用网络的图形化表示方法。
1、数据来源: 描述所使用的蛋白质互作数据的来源,可能包括已知的实验证据、文献数据库或预测算法。
2、网络构建: 解释如何根据蛋白质互作数据构建网络图,包括节点(蛋白质)和边(相互作用)的连接。
3、数据处理: 说明对原始数据进行的任何预处理或筛选,例如去除低置信度的相互作用或筛选特定的生物通路。
4、可视化选项: 提供不同的可视化选项,如网络图、热图或子网络分析,以帮助用户理解和解释蛋白质相互作用网络。
5、网络分析工具: 提供与PPI图相关的分析工具或功能,例如网络中心性指标计算、模块识别或功能注释。
6、交付物: 提供PPI图及其分析结果的交付物,如网络图像文件、关键节点列表或网络特征统计。
PPI图服务描述应当详细说明如何利用该方法来分析和可视化蛋白质相互作用网络,使用户能够理解蛋白质间的关系,并探索网络中的结构和功能特征。