富集分析GSEA基因分析
富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,简称GSEA)是一种用于解释基因表达数据的统计方法,用于确定在给定的基因集中,特定基因集的基因在两个或多个实验条件之间是否显著富集。
1、分析方法: 描述使用的算法和统计方法,通常基于排名或基因集的富集分析。
2、数据要求: 说明需要的输入数据类型,例如基因表达数据、基因列表或其他实验数据。
3、结果解释: 解释结果输出的格式和内容,可能包括富集的基因集、关键通路或功能分类信息。
4、可视化选项: 提供结果可视化的选项,如富集通路图或基因表达热图。
5、统计验证: 说明结果的统计验证方法,例如调整 p 值的计算或重复性分析。
6、交付物: 提供分析结果的交付物,如报告、表格或图表,以便用户理解和进一步分析结果。